检索审编通路,
带稳定标识符。
Reactome 是专家审编、同行评审的通路知识库 —— 被细致建模的反应与通路,各带一个稳定的 R-HSA 标识符。reactome_search 把它放上控制台,钉在那个编号上,作为 KEGG 之外对生物过程的第二种审编视图。
这件仪器做什么
Reactome 是一个开放、人工审编且经同行评审的人类通路与反应数据库 —— 分子事件被组织成可导航的层级,各带如 R-HSA-70171 的稳定标识符。
在控制台上,reactome_search 按名称或物种查询通路、反应与蛋白质,返回带稳定编号的条目 —— 是一个通路断言所解析的锚。
它在控制台上驱动的工具
reactome_search
仅供研究使用。服务名称归各自所有者所有,不代表任何合作或背书。
Perslis 如何集成 Reactome
Reactome 与 KEGG 都映射生物过程,但审编方式不同 —— 反应级细节对通路图 —— 因此控制台两者并留,而非择一。关于糖酵解的问题返回 Reactome 的 R-HSA-70171 与 KEGG 的 hsa00010,智能体看到对同一生物学的两种独立审编。
由于 Reactome 的蛋白质带着 UniProt 编号,在此找到的通路能回到蛋白质工作台 —— 正是把结构、预测与结构域串起来的同一个锚,如今把一个蛋白质放进它参与的反应中。
提问
在控制台问一个问题 —— 不用学每个服务的查询语言,不用切换标签页。
路由
Lois 与其他仪器一起调用它,并汇集返回的结果。
钉源
每个字段都保留来源:数据库、编号、URL。说不出来源的结果,在构造层面就被拒绝。
准入
PEEL 门决定什么能进入实验记录。转述的数值逐字保留;无依据的断言进不来。
一个真实、可溯源的结果
实时从该服务取回,并钉在它的标识符上 —— 与控制台上每个答案受同一契约约束。
| 首条通路 | Glycolysis |
|---|---|
| 稳定编号 | R-HSA-70171 |
| 类型 | Pathway |
| 物种 | Homo sapiens |
| 相关 | R-HSA-70326 Glucose metabolism |
来源: reactome · R-HSA-70171 · 取回于 2026-09-18
为什么经由同一个控制台调用 Reactome
可调用的审编通路
智能体触达钉在稳定 R-HSA 编号上的同行评审反应 —— 无需手动浏览。
第二种审编视图
Reactome 与 KEGG 并肩作答,于是一条通路的两种独立审编都摆上桌面。
回到蛋白质
Reactome 蛋白质带着 UniProt 编号,把一条通路系回结构工作台的锚。
Reactome 会对话的仪器
一条审编通路是一个过程的一种模型。Reactome 与 KEGG 及蛋白质锚并肩作答。
