取回实验解析结构,
并附文献与分辨率。
蛋白质数据库是实验测定三维结构的档案。pdb_search 与 pdb_entry 返回一个结构,并带上决定是否可信的事实 —— 方法、分辨率与主要文献 —— 钉在它的 PDB 编号与下载 URL 上。
这件仪器做什么
RCSB PDB 是由 X 射线晶体学、冷冻电镜与 NMR 解析的大分子结构的全球库。每个条目记录了它如何被测定、分辨率几何。
在控制台上,pdb_search 查找结构,pdb_entry 返回单个结构 —— 方法、分辨率、分子量、主要文献(含 DOI 与 PMID)以及直接的 .pdb/.cif 下载链接。
它在控制台上驱动的工具
pdb_search · pdb_entry
仅供研究使用。服务名称归各自所有者所有,不代表任何合作或背书。
Perslis 如何集成 RCSB PDB
PDB 是蛋白质的结构断言变得可核之处。一条 UniProt 条目列出其交叉引用的 PDB 编号;控制台沿其中之一直通 pdb_entry,分辨率与主要文献随之返回 —— 于是一个结构陈述始终带着背后的证据与论文。
实验结构被有意地与 AlphaFold 的预测同置一个工作台:智能体可将实测结构与预测结构对照,并从元数据看清孰为实测、孰为预测。
提问
在控制台问一个问题 —— 不用学每个服务的查询语言,不用切换标签页。
路由
Lois 与其他仪器一起调用它,并汇集返回的结果。
钉源
每个字段都保留来源:数据库、编号、URL。说不出来源的结果,在构造层面就被拒绝。
准入
PEEL 门决定什么能进入实验记录。转述的数值逐字保留;无依据的断言进不来。
一个真实、可溯源的结果
实时从该服务取回,并钉在它的标识符上 —— 与控制台上每个答案受同一契约约束。
| 标题 | Structure of human oxyhaemoglobin at 2.1 Å resolution |
|---|---|
| 方法 | X 射线衍射 |
| 分辨率 | 2.1 Å |
| 提交日期 | 1983-06-10 |
| 主要文献 | J Mol Biol 1983 · PMID 6644819 |
| 下载 | 1HHO.pdb / 1HHO.cif |
来源: pdb · 1HHO · 取回于 2026-09-18
为什么经由同一个控制台调用 RCSB PDB
可调用的结构
智能体取回带方法与分辨率的真实结构 —— 无需手动浏览 RCSB。
锚定到 UniProt
一个 UniProt 编号交叉引用的 PDB 编号在此直接解析 —— 一个蛋白质,它的结构。
证据随之而行
每个结构都带着分辨率与主要文献,于是可信是一个事实,而非感觉。
RCSB PDB 会对话的仪器
一个结构是蛋白质的一个视角。PDB 与它的 UniProt 锚、预测模型及结构域并肩作答。