把一个 rsID
解析为位置与等位基因。
dbSNP 是已知遗传变异的目录 —— 每个 rsID 的染色体位置、命中的基因、等位基因及 HGVS 记法。dbsnp_variant 解析其一,钉在组装版本上,并逐字报告任何临床意义 —— 是通往整个变异三角的入口。
这件仪器做什么
dbSNP(NCBI)是短序列遗传变异(SNP 与小 indel)的参考档案 —— 各带稳定 rsID、映射位置、等位基因、功能类别及任何汇总的临床意义。
在控制台上,dbsnp_variant 接收一个 rsID(带或不带 rs 前缀),返回它在指定组装版本上的位置、基因、等位基因,以及其他仪器所消费的 HGVS 字符串。
它在控制台上驱动的工具
dbsnp_variant
仅供研究使用。服务名称归各自所有者所有,不代表任何合作或背书。
Perslis 如何集成 dbSNP
dbSNP 是变异工作台的前门。在此解析的一个 rsID —— rs6025,凝血因子 V Leiden,位于 F5 基因 1:169,549,811 —— 随身带着组装版本与 HGVS 记法,可直接交给 VEP 预测效应、交给 ClinVar 作临床分类。一个标识符,三件仪器。
凡 dbSNP 汇总的临床意义,均逐字报告 —— 与 ClinVar 遵循的“绝不重新评级”规则相同 —— 并标注“仅供研究使用”。控制台上的变异总知道其坐标属于哪个基因组构建。
提问
在控制台问一个问题 —— 不用学每个服务的查询语言,不用切换标签页。
路由
Lois 与其他仪器一起调用它,并汇集返回的结果。
钉源
每个字段都保留来源:数据库、编号、URL。说不出来源的结果,在构造层面就被拒绝。
准入
PEEL 门决定什么能进入实验记录。转述的数值逐字保留;无依据的断言进不来。
一个真实、可溯源的结果
实时从该服务取回,并钉在它的标识符上 —— 与控制台上每个答案受同一契约约束。
| 位置 | 1:169,549,811(GRCh38) |
|---|---|
| 基因 | F5 |
| 等位基因 | C / A / G / T |
| 功能类别 | missense_variant |
| HGVS(蛋白) | NP_000121.2:p.Arg534Gln |
| 临床意义 | pathogenic, risk-factor, …(逐字) |
来源: dbsnp · rs6025 · 取回于 2026-09-18 · 仅供研究使用
为什么经由同一个控制台调用 dbSNP
变异的前门
一个 rsID 解析为 VEP 与 ClinVar 直接消费的坐标与 HGVS。
可调用,标注组装版本
智能体把变异解析为一个总写明基因组构建的位置 —— 没有含糊坐标。
意义逐字
汇总的临床意义原样报告,仅供研究使用 —— 绝不被模型重新评级。
dbSNP 会对话的仪器
一个已知变异通向它的效应与临床解读。dbSNP 与 VEP、ClinVar 并肩作答。
